一個重要的自身問題是這類系統的抗干擾能力，特別是使程序不受輸入信號波動的影響。輸入信號的波動與系統通信通道和信息傳感器通道中產生的干擾有關，也與模數轉換器和電源組件參數的暫態不穩定性有關。為了避免暫態不穩定性，采用了在設計微處理器控制系統時廣泛采用的硬件方法。作為避免干擾的編程手段，采用相同程序的二元和二元計算機方法是合理的。但是，當計算工具快速作用時，其應用是有限的。 
機組微處理器保護系統的設計以及在電廠條件下的運行經驗證明了微處理器系統在繼電保護和自動化方面的應用前景，與傳統的保護系統相比較，微處理器系統具有一系列重要的優點。這些優點是：設計算法時能夠采用全新的方法；在二次系統對象上的所有設備均規格化；各連續的自動監控和自診斷功能，大大減少重量與外形尺寸的指標